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珍藏版:生物医学科研必备神器一览
2018-11-09    来源:整理于网络

一、OA论文平台(常用的如下)


1、DOAJ期刊检索平台

瑞典的隆德大学设立于2003年5月,已收录OA期刊6596种,文章超过57万篇。该目录收录的均为学术性、研究性期刊,具有免费、全文、高质量的特色,质量源于所收录的期刊实行同行评审,或有编辑做质量控制,故对学术研究有很高的参考价值。

链接:http://doaj.org/

 

2、High WirePress电子期刊

High wirepress是全球最大的三个免费提供全文的学术文献出版商之一,于1995年由美国斯坦福大学图书馆创立,目前已收录电子期刊710种,文章数达230万篇,其中超过77万篇文章可免费获得全文。在High wire press网络平台上有三种OA方式:(1)完全OA的期刊;(2)免费试用的期刊,在一段试用期可以免费获得期刊全文;(3)延迟OA期刊,不能免费看最新的全文,但是可以获取几个月前或是1-2年之前期刊全文。

链接:http://home.highwire.org/

 

3、PLOS系统 

Plos科学公共数据库出版了8种生命科学与医学领域的开放获取期刊,可以免费获取全文,比较具有影响力,plos系列的期刊都已经被SCI收录。

链接:http://www.plos.org/

 

4、BioMedCentral系列

 BMC目前已经成为世界领先的生物医学OA期刊出版商,仅有几年历史的BMC出版的部分OA期刊最近收到了与传统领域期刊相比更高的JCR影响因子。目前BMC网络平台共出版和收录期刊300余种,其中有200余种期刊的全部论文可立即和永久在线获取。

链接:http://www.biomedcentral.com/

 

5、Socolar

 Socolar开放存取一站式检索服务平台是一个旨在为用户提供OA资源检索和全文链接服务的公共服务平台,由中国教育进出口公司管理。该平台是中文网页,收录了6000多种来自互联网的Open Access期刊、仓储等学术资源信息,提供一站式检索和链接服务。读者需要注意的是,链接到最后是否获取全文,取决于平台链接的有效性,用户网络是否允许境外访问两个因素。

链接:http://www.socolar.com/

 

6、cnpLINKer 

cnpLINKer中国链接服务是由中国图书馆进出口总公司开发并提供的国外网络检索系统。目前共收录了国外50多家出版社的12000余种商业期刊,14000多种Open Access,900万篇文摘数据和全文链接服务,400多家OPAC信息,并保持时时更新。

链接:http://cnplinker.cnpeak.com/

 

7、OALib 

OALib是Open access library简称,目前已经存有258647篇免注册,免费使用下载的英文期刊论文,这些论文大部分来自国际知名出版社,其中包括Hindawi, PLOS ONE, MDPI, Scientific researchpublishing等。

链接:http://www.oajs.org/

 

8、开放阅读期刊联盟 

开放阅读期刊联盟是由中国高校自然科学学报研究会发起的,期刊出版后,在网站上提供全文免费供读者阅读,或应读者要求,在3个工作日之内免费提供各期刊发表过的论文全文。不过只提供几十家期刊而已,数量少得可怜,大家可以考虑忽略他,有兴趣去观摩下的小伙伴输入下面的链接。

链接:http://www.oajs.org/

 

二、翻墙上Google


Lantern是一个免费的桌面程序。它能帮助你随时随地快速、可靠、安全地访问互联网(通俗简单来说就是翻|墙)。也被称之为灯笼或者蓝灯或者灯塔。它目前支持:Windows、Linux、Android、Mac OS X系统。

Lantern让用户能流畅地访问被封锁的互联网站点。Lantern自动检测一个网站是否被封锁。对那些被封锁的网站,Lantern通过自有的服务器,或者未封锁地区的用户运行的Lantern,来提供访问。如果网站没有被封锁,Lantern选择靠边站。浏览器就能直接访问网站,速度不受影响。Lantern使用了一系列技术来对抗封锁。一种技术被封了,就自动试用别的方法。其中包括复杂的P2P架构。人越多访问越快.大多数使用过的朋友,都提示说非常好用。

 

三、文献整理

 

1、EverNote/有道云笔记

 

对于这两个软件大家都不陌生。EverNote又名印象笔记,是目前最火热的笔记软件之一,除了文字信息还可以记录语音,图片等等,好处就在于多平台同步,还有网页剪报功能,让你随时随地记录收藏好的idea;有道云笔记功能类似,是我们本土化的产品,所占内存比EverNote小一些,而且更贴近国人习惯。上述方便快速,可随手记下你的idea,支持多平台同步。缺点在于需要定期自己整理,否则东西过于杂乱。(大家百度一下,下载很方便)

 

2、docear(思维导图制作软件)

 

这是一款很好的学术文献和思想整理软件。基于思维导图模式,在pdf文件上高亮文本或做完标记导入docear后,可以直接显示出来所做的标记,然后自己可以根据逻辑关系对文献进行整理和关联。

 

3、词典类

 

1、google翻译:这个地球人都知道,但是现在要翻墙哎。

 

2、有道/金山翻译软件

有道或金山比较全面,带很多扩展功能,包括全文翻译、屏幕取词、划词翻译、例句搜索、网络释义、真人语音朗读等。还可将单词存入生词本,依靠云同步随时复习,适合词汇量积累。不好的地方就是,比较占系统内存,小广告多。

 

四、制图类

 

1、Visio 

这是微软旗下的一款信息流程软件,功能强大。可以用来画各种流程图,写标书时妥妥用得上,

 

2、Graphapd Prism

 是一款数据分析和制图于一体的数据处理软件

 

五、文献生成/管理工具

 

1、Endnote 

EndNote是一款强大的文献管理软件。使用起来也很方便,只要把你所看的文献都导入到这个软件中,它便会自动生成文献列表,更贴心的是它还可以作为word加载项来运行,也就是说可以直接在word中进行操作。另外,你可以根据关键词来搜索文献库中文献,使用起来很方便。优点:使用方便,占用内存少;缺点:本想说要收费,但可自行度娘破解版。

 

2、NoteExpress 

NoteExress总体功能上和EndNote差不多,是一款国内的软件,所以相对而言对国内数据库的支持性更加好一些。优点:功能性EndNote类似,使用上更顺手些;缺点:国外期刊支持性不如Endnote。

 

3、RSS订阅文献 

RSS是款订阅文献的小工具

 

六、科研工具

 

1、DNASTAR 

相当好用的序列分析软件……之一,设计引物之前,还是要先看看有没有同源性不是么?

 

2、AelleID6.0

qPCR引物设计的利器,当然不用三分钟就能设计出合适的qPCR引物,你值得拥有呢!

 

3、AmiGo 2 

芯片的GO分析工具,其实还挺好用的。

 

4、KEGG Pathway 

Pathway的注明数据库,还是有蛮多内容的呢,

 

5、WebGestalt 

集GO分析及Pathway分析于一体,不过登陆啊注册啊比较麻烦啦。

 

6、Oncomine

 ONCOMINE:一个癌症微阵列数据库和整合数据挖掘平台。DNA微阵列技术已经导致肿瘤基因组分析的一个爆炸,产生了大量数据,并覆盖了癌症的复杂基因表达模式。不幸的是,由于缺乏一个统一的生物信息学资源,大多数这些数据在发表后处于停滞且杂乱的状态,没有被癌症研究社区大规模地充分利用。这里,我们提出了ONCOMINE(http://www.oncomine.org),一个癌症微阵列数据库和基于网络的数据挖掘平台,旨在促进来自全基因组表达分析的发现。迄今为止,ONCOMINE包含了由差不多4800万个基因表达测量组成的65套基因表达数据集,构成了超过4700个微阵列实验。比较最主要的癌症类型和各自的正常组织的差异表达分析,以及各种癌症亚型和基于临床及基于病理学的分析可以进行探索。跨所有分析的一个挑选的基因或一个挑选的分析中的多个基因的数据能够被查询及可视化。此外,基因集合能够限制到临床上重要的注释,包括分泌的、激酶、膜和已知基因-药物靶点对以促进新的生物标志物和治疗靶点的发现。

 

7、LcnRNA数据库 

包括了NONCODE、lncRNAdb、CHIPbase、LncRNome、Starbase、LncRNADisease等等

 

8、Micro RNA的Target Gene查找 

是不是在愁不知道怎么去搜MicroRNA的Target Gene?那看看Target Scan、PicTar、MiRanda就知道了吧。

 


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